Informace o projektu
Vytvoření výzkumného týmu a mezinárodního konzorcia pro počítačový model buňky sinice
(CyanoTeam)
- Kód projektu
- CZ.1.07/2.3.00/20.0256 (kod CEP: EE2.3.20.0256)
- Období řešení
- 4/2012 - 3/2015
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Operační program Vzdělávání pro konkurenceschopnost (VK)
- 2.3 Lidské zdroje ve výzkumu a vývoji
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Spolupracující organizace
-
Ústav systémové biologie a ekologie AV ČR, v. v. i.
Cílem projektu je posílit konkurenceschopnost českých vědců a doktorandů v oblasti bioinformatiky, bioenergetiky a počítačové vědy.
Cíle bude dosaženo vytvořením mezioborového vědeckého týmu CZ CyanoTeam vedeného
zahraničními experty. Druhým nástrojem bude konzorcium Global CyanoNetwork sdružené k zajištění spolupráce se zahraničními partnery.
Významným cílem bude i povýšení mezinárodního postavení zúčastněných vědeckých
pracovníků a doktorandů. Toho bude dosaženo spoluprací s hostujícími experty v CZ CyanoTeamu tak i zapojením v mezinárodních výzkumných programech v Global
CyanoNetworku. K posílení lidských zdrojů budou pořádány každoroční letní školy a semináře.
FI MU jako partner projektu s finanční podporou se bude účastnit vědeckého výzkumu (vývoj nástrojů pro analýzu a integraci vytvářených modelů). FI MU bude odpovědná za realizaci aktivity přesunu nových znalostí do výuky v rámci oboru bioinformatika na FI.
Publikace
Počet publikací: 14
2015
-
Compact Representation of Photosynthesis Dynamics by Rule-based Models
5th International Workshop on Static Analysis and Systems Biology (SASB 2014), rok: 2015
-
CyanoNetwork workshop - Cyanobacterium in silico 2015
Rok: 2015, druh: Uspořádání workshopu
2014
-
Biochemical Space: A Framework for Systemic Annotation of Biological Models
Proceedings of the 5th International Workshop on Interactions between Computer Science and Biology (CS2Bio’14), rok: 2014
-
Epsilon-Semantics computations on biological systems
Information and computation, rok: 2014, ročník: 236, vydání: 1, DOI
-
Robustness Analysis of Stochastic Biochemical Systems
Plos One, rok: 2014, ročník: 9, vydání: 4, DOI
-
STL*: Extending signal temporal logic with signal-value freezing operator
Information and computation, rok: 2014, ročník: 236, vydání: January, DOI
2013
-
A Comprehensive Web-based Platform For Domain-Specific Biological Models
Proceedings of the fourth International Workshop on Interactions between Computer Science and Biology (CS2Bio'13), rok: 2013
-
Esther: Introducing an Online Platform for Parameter Identification of Boolean Networks
Computational Methods in Systems Biology 11th International Conference, CMSB 2013, Klosterneuburg, Austria, September 22-24, 2013, Proceedings, rok: 2013
-
Exploring Parameter Space of Stochastic Biochemical Systems Using Quantitative Model Checking
25th International Conference, CAV 2013, Saint Petersburg, Russia, July 13-19, 2013. Proceedings, rok: 2013
-
Model Checking of Biological Systems
Formal Methods for Dynamical Systems, rok: 2013