Informace o projektu
Comprehensive prognostic and predictive panel for chronic lymphocytic leukemia: a next-generation sequencing tool suitable for clinical practice and study of genetic architecture behind the disease progress
- Kód projektu
- NV19-03-00091
- Období řešení
- 5/2019 - 12/2022
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu a vývoje na léta 2015 - 2022
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Brno
- Odpovědná osoba Mgr. Veronika Navrkalová, Ph.D.
Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is common and still incurable leukemia of adults characterized by remarkable genetic and clinical heterogeneity. In proposed project we aim to study genetic background underlying clonal evolution of genomic alterations in treatment naïve CLL patients taking the advantage of availability of consecutive samples collected during disease course. Our main objective is to early disclose the disease progression and therapy need. We plan to assess both the prognostic and the predictive value of genomic aberrations detected just before treatment start. For this purpose, a highly complex next-generation sequencing (NGS) tool analyzing simultaneously both fundamental, as well as novel CLL biomarkers will be implemented. We employ benefits of capture-based NGS technology enabling to analyze in one test IGHV mutational status, recurrent chromosomal and gene defects, and Ig light chains clonality. We presume that our NGS panel tailored for CLL can be widely adopted in clinical practice as a simple comprehensive test for better patient prognostication.
Publikace
Počet publikací: 47
2021
-
LYNX (Lymphoid next-generation sequencing): NGS panel a bioinformatic tool for integrative analysis of prognostic and predictive markers in B-cell malignancies.
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
-
LYNX (Lymphoid next-generation sequencing): NGS panel a bioinformatický nástroj pro integrativní analýzu prognostických a prediktivních markerů B-buněčných lymfoproliferací.
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
-
LYNX: an interactive bioinformatic tool for capture-based next-generation sequencing data analysis in lymphoid malignancies.
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
-
Maskovaná hypodiploidie u pacientů s akutní lymfoblastickou leukémií
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
-
RPS15 mutations rewire RNA translation in chronic lymphocytic leukemia
BLOOD ADVANCES, rok: 2021, ročník: 5, vydání: 13, DOI
-
T-buněčný lymfoblastický lymfom (T-LBL) dětského věku s kazuistikou geneticky zajímavého případu
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
2020
-
Capture-based NGS panel for detection of immunoglobulin and T-cell receptor gene rearrangements in DNA samples from patients with acute lymphoblastic leukemia
Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty
-
International prognostic score for asymptomatic early-stage chronic lymphocytic leukemia
Blood, rok: 2020, ročník: 135, vydání: 21, DOI
-
LYNX – modulární bioinformatický nástroj s uživatelským rozhraním pro analýzu NGS da u pacientů s hematologickými malignitami
Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty
-
LYNX (Lymphoid NGS): a versatile NGS panel for comprehensive analysis of molecular markers with clinical relevance in lymphoproliferative disorders
Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty