Project information
Host microbiome in relation to Barrett ´s esophagus and esophageal adenocarcinoma development
- Project Identification
- NU20-03-00126
- Project Period
- 5/2020 - 12/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Health Research Programme 2020 - 2026
- Subprogram 1 - standard
- MU Faculty or unit
- Faculty of Medicine
- Other MU Faculty/Unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
University Hospital Olomouc
- Responsible person Doc. MUDr. Ondřej Urban, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Tomáš Haruštiak, Ph.D.
- Responsible person prof. MUDr. Robert Lischke, Ph.D.
- Responsible person Štěpán Hlava
- Responsible person prof. MUDr. Zdeněk Kala, CSc.
- Responsible person doc. MUDr. Radek Kroupa, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Tomáš Grolich, Ph.D.
- Responsible person doc. MUDr. Lumír Kunovský, Ph.D.
- Responsible person Zdeněk Pavlovský
- Responsible person doc. MUDr. Jiří Dolina, Ph.D.
- Responsible person doc. MUDr. Vladimír Procházka, Ph.D.
Hostitelský mikrobiom spolu s genetickou predispozicí jedince jsou důležitými faktory
v etiopatogenezi refluxní choroby jícnu (GERD), která významně zvyšuje riziko rozvoje ezofagitidy (RE), Barrettova jícnu (BE) a adenokarcinomu ezofagu (EAC). Cílem projektu je determinace markerů na úrovni mikrobiomu, genů hostitele a jejich interakcí pro časnější diagnostiku a predikci rozvoje BE a EAC.
Projekt obsahuje 3 části: (1) analýzu metagenomu a metatranskriptomu v několika lokalitách
gastrointestinálního traktu (GIT) u pacientů s GERD, (2) analýzu hostitelského exomu a transkriptomu ve tkáni jícnu u pacientů s BE/EAC, a (3) analýzu genetického profilu pacientů s GERD a jeho komplikacemi. Mutace v exomu/genomu pacienta a míra exprese genů ve tkáni jícnu budou korelovány s mikrobiomem a jeho funkční aktivitou v GITu a klinickým nálezem doplněným o in vivo endomikroskopii.
Na základě získaných dat se pokusíme navrhnout modifikaci standardního režimu péče o pacienty s GERD s cílem předejít pokročilým a ireverzibilním změnám snižujícím kvalitu života pacientů, resp. ohrožujících je na životě.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.
Publications
Total number of publications: 30
2021
-
Helicobacter pylori infection and other bacteria in pancreatic cancer and autoimmune pancreatitis
World Journal of Gastrointestinal Oncology, year: 2021, volume: 13, edition: 8, DOI
-
Increased TRPV1 gene expression in the tissues of Barrett's esophagus and esophageal adenocarcinoma
Year: 2021, type: Conference abstract
-
Myofibroblastic tumor of the esophagus - a case report of long-term follow-up and literature review
Klinická onkologie, year: 2021, volume: 34, edition: 4, DOI
-
Myofibroblastický nádor jícnu
Year: 2021, type: Conference abstract
-
Orální mikrobiota a hojení sliznice dutiny ústní
Year: 2021, type: Conference abstract
2020
-
Biomarkery pro neendoskopické vyšetření sliznice jícnu
Vnitřní lékařství, year: 2020, volume: 66, edition: 7
-
Confocal laser endomicroscopy in the diagnostics of esophageal diseases: a pilot study
Vnitřní lékařství, year: 2020, volume: 66, edition: 5
-
Herpetic esophagitis in a 7-year-old immunocompetent patient
Gastroenterologie a Hepatologie, year: 2020, volume: 74, edition: 3, DOI
-
Incidence trends of esophageal cancer in the Czech Republic by histological subtype and stage and prescription rate of acid suppressing drugs
Cancer epidemiology, year: 2020, volume: 69, edition: DEC 2020, DOI
-
The microbiome of the esophagus, stomach and duodenum in patients with gastroesophageal reflux disease - pilot study
Year: 2020, type: Conference abstract